W redakcji czasopisma, w którym pracuję, mamy następujący problem. Chodzi o pisownię skrótu podstawowa opieka zdrowotna. Nasze autorki piszą: POZ. Redaktor naczelna uważa, że powinno się pisać p.o.z.
Z wyrazami szacunku - Stella N.P.

Obie formy są poprawne, zarówno skrótowiec POZ, jak i skrót p.o.z.
Skrótowiec (np. POZ) nie musi być skróceniem nazwy własnej, a można podejrzewać, że redaktor naczelna właśnie to ma na uwadze (podstawowa opieka zdrowotna to nazwa pospolita). Jeśli tak uważa, to niesłusznie.
Jednak obowiązuje zasada, że w danej publikacji, redakcji, w danym wydawnictwie przyjmuje się jedną z wersji obocznych i taką konsekwentnie stosuje.
W instytucjach i innych zespołach wybór najczęściej należy do szefa (jeśli się tym interesuje), który zazwyczaj najlepiej orientuje się w całości publikacji.